Der Verwaltungsrat ist das zusätzliche Kontrollgremium des Kindermissionswerks. Er berät und überwacht die Arbeit des Vorstands. Die Tätigkeiten des Verwaltungsrats sind ehrenamtlich und werden nicht vergütet. Die Mitglieder werden im Wesentlichen von der Mitgliederversammlung berufen und gewählt.

Der Verwaltungsrat hat im Jahr 2015 drei Mal getagt. Er hat auch im Jahr 2015 gemäß seiner Aufgabe die Arbeit des Vorstands geprüft und ihn entlastet. Der aus Mitgliedern des Verwaltungsrats gebildete Anlageausschuss hat einen Entwurf für Richtlinien zur Geldanlage des Kindermissionswerks vorgelegt, der in der Sitzung im November beschlossen wurde. Ebenso hat der Verwaltungsrat den Bericht der Ombudsperson zur Korruptionsbekämpfung entgegengenommen, demzufolge kein Verdacht auf Korruption innerhalb des Vereins vorlag. Der Prüfungsauftrag für das Jahr 2016 wurde erneut an die Wirtschaftsprufungsgesellschaft Schleicher & Dr. jur. Robertz GmbH & Co. KG in Aachen gegeben.